Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc2Q9R244 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms