Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a3Q9QZS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a3Q9QZS0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms