Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnt3Q9QZ47 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tnnt3Q9QZ47 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tnnt3Q9QZ47 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tnnt3Q9QZ47 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnt3Q9QZ47 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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