Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VapbQ9QY76 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VapbQ9QY76 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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