Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms