Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms