Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dkk3Q9QUN9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms