Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhoaQ9QUI0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
RhoaQ9QUI0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms