Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prg4Q9JM99 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prg4Q9JM99 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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