Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gde1Q9JL56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gde1Q9JL56 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms