Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK91

Mlh1, DNA mismatch repair protein Mlh1, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlh1Q9JK91 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mlh1Q9JK91 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms