Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra4Q9JJT2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms