Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms