Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn12Q9ET43 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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