Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cse1lQ9ERK4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms