Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms