Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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