Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms