Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp2aQ9DB34 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp2aQ9DB34 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms