Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms