Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms