Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vstm5Q9D806 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms