Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9bQ9D6E4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms