Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms