Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms