Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms