Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef12Q9D2F1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef12Q9D2F1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms