Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trappc6bQ9D289 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trappc6bQ9D289 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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