Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms