Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms