Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vps28Q9D1C8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms