Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc3Q9D114 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms