Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms