Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms