Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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