Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms