Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms