Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b1Q99NB9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b1Q99NB9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms