Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrrtQ99MR6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms