Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp1b4Q99ME6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp1b4Q99ME6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms