Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms