Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gps1Q99LD4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms