Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim11aQ99J19 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Smim11aQ99J19 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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