Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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