Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip1Q922J3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms