Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pde6cQ91ZQ1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pde6cQ91ZQ1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pde6cQ91ZQ1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms