Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc1Q91Z38 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc1Q91Z38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc1Q91Z38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms