Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csde1Q91W50 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms