Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zkscan3Q91VW9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zkscan3Q91VW9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zkscan3Q91VW9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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