Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39cQ8VE09 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms